Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TWISTNBQ3B726 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms