Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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CNGA3Q16281 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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CNGA3Q16281 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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CNGA3Q16281 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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