Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC85BQ15834 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC85BQ15834 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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