Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
SS18Q15532 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SS18Q15532 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SS18Q15532 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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SS18Q15532 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SS18Q15532 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SS18Q15532 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SS18Q15532 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SS18Q15532 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SS18Q15532 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SS18Q15532 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SS18Q15532 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SS18Q15532 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SS18Q15532 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SS18Q15532 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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