Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAPVD1Q14C86 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAPVD1Q14C86 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
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