Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
NR1D2Q14995 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms