Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMC1AQ14683 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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