Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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TRIM25Q14258 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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TRIM25Q14258 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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TRIM25Q14258 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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TRIM25Q14258 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
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TRIM25Q14258 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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TRIM25Q14258 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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TRIM25Q14258 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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TRIM25Q14258 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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