Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CKAP5Q14008 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CKAP5Q14008 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms