Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GTF2H3Q13889 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms