Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMS2P11Q13670 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PMS2P11Q13670 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms