Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEUROD1Q13562 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEUROD1Q13562 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms