Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3BQ13370 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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