Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AP3B2Q13367 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms