Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
STRN3Q13033 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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