Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GRIK3Q13003 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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