Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
GRIK2Q13002 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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GRIK2Q13002 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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GRIK2Q13002 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GRIK2Q13002 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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GRIK2Q13002 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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GRIK2Q13002 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GRIK2Q13002 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GRIK2Q13002 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GRIK2Q13002 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GRIK2Q13002 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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