Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CYP4F3Q08477 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms