Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SCN1BQ07699 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms