Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPN12Q05209 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms