Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LMO4P61968 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LMO4P61968 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LMO4P61968 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LMO4P61968 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LMO4P61968 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LMO4P61968 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LMO4P61968 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LMO4P61968 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LMO4P61968 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LMO4P61968 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms