Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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CLDN15P56746 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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CLDN15P56746 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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CLDN15P56746 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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CLDN15P56746 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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CLDN15P56746 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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CLDN15P56746 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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CLDN15P56746 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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CLDN15P56746 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CLDN15P56746 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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