Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PGGT1BP53609 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PGGT1BP53609 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PGGT1BP53609 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PGGT1BP53609 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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PGGT1BP53609 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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PGGT1BP53609 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
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PGGT1BP53609 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PGGT1BP53609 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
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