Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ME1P48163 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ME1P48163 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ME1P48163 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ME1P48163 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ME1P48163 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ME1P48163 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ME1P48163 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ME1P48163 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ME1P48163 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ME1P48163 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ME1P48163 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ME1P48163 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ME1P48163 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ME1P48163 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ME1P48163 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ME1P48163 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ME1P48163 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ME1P48163 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ME1P48163 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ME1P48163 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms