Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GRIA4P48058 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GRIA4P48058 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms