Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms