Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNGA1P29973 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms