Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
KDELR1P24390 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDELR1P24390 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms