Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC9A1P19634 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104 ms