Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATF6P18850 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATF6P18850 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATF6P18850 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATF6P18850 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATF6P18850 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATF6P18850 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATF6P18850 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ATF6P18850 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATF6P18850 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATF6P18850 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATF6P18850 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATF6P18850 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms