Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms