Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC130P13994 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms