Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GP1BBP13224 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms