Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMIGD3P0DMS9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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