Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM228BP0C875 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms