Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI1P08151 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI1P08151 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI1P08151 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI1P08151 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI1P08151 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI1P08151 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI1P08151 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI1P08151 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GLI1P08151 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GLI1P08151 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GLI1P08151 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GLI1P08151 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms