Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDN1P05305 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDN1P05305 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EDN1P05305 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDN1P05305 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDN1P05305 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EDN1P05305 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDN1P05305 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDN1P05305 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDN1P05305 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDN1P05305 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDN1P05305 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDN1P05305 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDN1P05305 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDN1P05305 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDN1P05305 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDN1P05305 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDN1P05305 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDN1P05305 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDN1P05305 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDN1P05305 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EDN1P05305 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDN1P05305 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDN1P05305 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDN1P05305 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDN1P05305 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDN1P05305 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDN1P05305 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDN1P05305 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDN1P05305 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDN1P05305 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDN1P05305 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDN1P05305 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDN1P05305 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDN1P05305 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDN1P05305 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDN1P05305 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDN1P05305 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDN1P05305 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDN1P05305 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDN1P05305 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDN1P05305 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDN1P05305 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EDN1P05305 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDN1P05305 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDN1P05305 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms