Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGB3P05106 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms