Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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ZBED1O96006 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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ZBED1O96006 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZBED1O96006 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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