Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TO15178 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TO15178 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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