Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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PTPRTO14522 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRTO14522 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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