Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EBAG9O00559 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EBAG9O00559 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms