Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA1C9JL84 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms