Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ISM1B1AKI9 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms