Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 BIVM-201ENST00000257336 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 FP325332.1-201ENST00000624818 2045 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 POLA2-201ENST00000265465 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 AL162727.1-201ENST00000437712 3043 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 LINC02133-202ENST00000569726 2626 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 LBHD1-204ENST00000431002 2915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ZNF300-203ENST00000418587 3226 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 MYL9-201ENST00000279022 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 RSU1-201ENST00000345264 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 PCSK1-202ENST00000508626 2234 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ZNF75D-201ENST00000370764 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 DIS3-205ENST00000545453 3651 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 AC006037.2-201ENST00000622975 2232 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 GRPEL2-201ENST00000329271 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 TP53AIP1-206ENST00000602346 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VGLL3A8MV65 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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