Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SH3BP1Q9Y3L3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SH3BP1Q9Y3L3 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SH3BP1Q9Y3L3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SH3BP1Q9Y3L3 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SH3BP1Q9Y3L3 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SH3BP1Q9Y3L3 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SH3BP1Q9Y3L3 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SH3BP1Q9Y3L3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SH3BP1Q9Y3L3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SH3BP1Q9Y3L3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SH3BP1Q9Y3L3 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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