Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms