Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
DKK2Q9UBU2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms