Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHPF2Q9P2E5 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms