Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC180Q9P1Z9 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC180Q9P1Z9 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms